创新一 人文关爱和素质教育融入整个实验教学，在尽可能贴近临床真实环境和更符合医学伦理学方式下进行医学实践教学。
中心秉承“见物见人、熟技通理”的教学理念，在实验教学和改革中特别注重医学伦理和职业素养培育。强调医学生不能只见病不见人，即使是虚拟仿真实验也要时刻有治病救人的理念和感受，实验过程加强技能操作的仁心大爱教育。如在PACS实验教学系统虽图片来自真实病人，但已较好屏蔽病人隐私；对部分验证性实验采用虚拟仿真技术予以替代，充分体现了动物实验的“3R原则”，反映了实验动物科学由技术上的严格要求转向人道主义的管理，提倡实验动物福利与动物保护的国际总趋势。虽为虚拟实验，却处处体现真情，使学生不仅提高了对实验本身关注，同时也陶冶了情操，为他们将来成长为“卓越医师”奠定基础。
创新二 有限度使用医疗真实数据，使临床实践和学校教育真正深度融合，充分体现“虚实结合、相互补充、能实不虚”的原则，为培养学生实践能力和自主创新能力培养提供强有力保障。
学校的许多数据和案例来自真实病人的改编，使得教学内容和临床实际紧密结合。在部分虚拟仿真实验项目的模型构建和内容设计时，许多紧密合作的校外实践基地以及公司主动为相关内容提出修改建议和医疗、实验实际操作与要求；在软件编制与界面设计中，合作的软件公司反复与专任教师进行沟通，不断磨合与改善，大大提高了软件的使用价值，以提高了教学质量和效果。
创新三 提供开放式实验环境，为学生主动、自主学习提供环境和条件，增强社会辐射示范效应。
虚拟仿真实验可以真正实现实验室向学生开放，学生可以打破时空限制完成相关实验。由于虚拟仿真系统的支持，学生可以自拟、自选实验题目，自行组织实验，反复操作演练，使用现成的仪器开发进行实验，摒弃传统灌输式教学方式，让学生自主参与到教学中来，最大限度地发挥学生的主动性和创造性。此外，学生实验课如果对实验结果不满意或对实验过程不熟练, 课后也能做到反复练习，反复再现实验情境，不仅避免了重复建设，节约了投资，而且可以集中资金，提高实验装备水平，使教学内容和环境更加贴近临床实际，也达到最大限度掌握实践技能的目的。
另外，中心同时为国家执业医师资格考试考官培训和技能考试基地、国家级大学生校外实践基地、温州市科普基地，建有课程学习中心，方便在校医学生、住院医师和全科医师培训学习，将校内资源辐射校外临床实践基地和兄弟院校。随着医学虚拟实验资源的增加和服务器带宽承载量等硬件条件改善，中心将更多面向社会开放虚拟实验资源，形成医学行业内具有影响力的虚拟实验培训中心，增强社会辐射示范效应。
